فعالیت موزه علوم زمین مشهد از سال 1385 در فضایی به وسعت حدود 400 متر مربع (شامل: نمایشگاه، مخزن، آزمایشگاه آماده سازی و شستشوی نمونه ها، اتاق عکسبرداری) آغاز شده و هم اکنون در آن بیش از 2500 نمونه سنگ، کانی، فسیل و گوهرسنگ برای بازدید عموم به نمایش گذاشته شده است. هدف از راه اندازی این موزه، افزون بر گردآوری نمونه های سیستماتیک ایران، فراهم نمودن بستری مناسب برای بازدیدکنندگان است تا از زمینی که بر روی آن زندگی می کنند و همه نیاز خود را از آن به دست می آورند، شناخت بهتری داشته باشند.